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家庭世代业医,祖父是一位行医(俗所谓走方郞中),弃世时,李时珍方在襁褓中。但他的父亲李言闻,却已考得秀才,是一位儒医,和成功的医学写作家。曾经做过太医院内一个下级医官,叫做「吏目」,著有五部医书。在两子一女中,对于李时珍的寄望最切,所以当他在童年的时候,就敎他读「尔雅」。虽然李时珍自幼身体就不太强健,然而,他非常勤奋,特别对于自然界生物的观察,感觉极大的兴趣。因为他有遗传上的禀赋,以及在那样的家庭环境里,所以关于生物的知识,早已萌芽在他的幼小心灵中了。李言闻
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